玄帝殿是南岩宫的主体建筑，永乐十年（1412）敕建。民国十五年（1926）毁于火灾。2004年6月30日玄帝殿动工修复，它严格按照古建筑修缮原则进行修复，内奉玄天上帝，是武当山规模最大的泥塑贴金神像。

        出玄帝殿左行是通往元代石殿的廊道，右行十分钟即可到达真武修炼成仙的圣地“飞升崖”。